フォルスコリンとIBMXは、細胞内のcAMPレベルを上昇させ、それによってPKAの活性を増強することによって働く。増強されたPKA活性は、GKAP1のシグナル伝達環境内の標的をリン酸化し、GKAP1の状態や相互作用を変化させる可能性がある。同様に、塩化リチウムとSB 216763によるGSK-3の阻害は、GKAP1ネットワーク内のタンパク質のリン酸化パターンを変化させ、それによってスカフォールドタンパク質の機能を調節する可能性がある。
GKAP1活性のランドスケープにさらに影響を与えるのは、カルシウムシグナル伝達経路を調節するKN-93やBAPTA-AMのような化合物である。KN-93はCaMKIIを阻害することでこれを達成し、BAPTA-AMは細胞内カルシウムをキレート化することで、GKAP1の細胞内での役割に影響を与える波紋を作り出す。キナーゼの面では、PD98059はMEKを阻害し、SP600125はJNKを標的とし、LY294002はPI3Kの活性を抑制する。これらのキナーゼを選択的に阻害することで、それぞれの化学物質は異なるシグナル伝達カスケードの活性化状態を変化させ、その中でGKAP1がどのように機能するかに影響を与える可能性がある。
ラパマイシンは、細胞増殖と代謝の重要な調節因子であるmTORを阻害するが、シグナル伝達経路が相互に関連していることから、GKAP1にも間接的な影響を及ぼす可能性がある。Y-27632はROCKを阻害することによりアクチン細胞骨格を破壊し、細胞構造に影響を与え、GKAP1の相互作用と活性の制御に寄与する可能性がある。オカダ酸は、タンパク質リン酸化酵素PP1とPP2Aを阻害することにより、GKAP1が関与するリン酸化平衡とタンパク質相互作用ネットワークに影響を与え、このグループを締めくくる。
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