Os inibidores da GDE3 englobam substâncias químicas que, embora não visem diretamente a GDE3, modulam o domínio mais vasto do metabolismo lipídico em que a GDE3 opera. Entre esses produtos químicos actuam em vários nós do processamento e sinalização dos lípidos, oferecendo um potencial controlo indireto da atividade da GDE3. Por exemplo, o Orlistat inibe as lipases, enzimas essenciais para a decomposição das gorduras da dieta, oferecendo uma ligação ao ambiente metabólico da GDE3. Do mesmo modo, o fenofibrato e a rosiglitazona, através do seu agonismo dos receptores PPAR, proporcionam uma modulação mais ampla das vias do metabolismo lipídico que podem interagir indiretamente com o domínio de operações da GDE3.
Além disso, o conjunto de estatinas - Atorvastatina, Sinvastatina e Lovastatina - lança luz sobre outra faceta do metabolismo lipídico: a síntese do colesterol. Ao inibirem a HMG-CoA redutase, perturbam a via do mevalonato, influenciando indiretamente várias enzimas modificadoras dos lípidos, incluindo potencialmente a GDE3. De forma semelhante, inibidores como o GGTI-298 e o FTI-277 obstruem modificações lipídicas específicas nas proteínas, o que pode criar um efeito de cascata nos processos do metabolismo lipídico em que a GDE3 está implicada.
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