Gap1阻害剤は、Gap1の機能を減衰させる効果を発揮するために、様々な分子接点で作用する。例えば、LY294002とWortmanninはホスファチジルイノシトール3キナーゼ(PI3K)阻害剤であり、PI3K-Aktシグナル伝達カスケードを阻害する。この阻害による下流の効果は、Gap1の細胞膜への移動の減少である。ラパマイシンはもう一つの注目すべき例であり、TORC1の機能を特異的に阻害するmTOR阻害剤として作用する。この複合体を阻害することにより、ラパマイシンはGap1を細胞膜から遠ざけ、細胞局在に影響を与える。さらに、スタウロスポリンやカルホスチンCのようなPKC阻害剤は、Gap1をリン酸化し、その結果活性化することが知られているプロテインキナーゼCを阻害する。PKC阻害剤によってこのリン酸化イベントが阻害されると、Gap1は不活性化される。
さらに、Srcキナーゼに対するPP2、MEKに対するU0126やPD98059、p38 MAPKに対するSB203580、JAK2に対するAG490など、シグナル伝達経路の特定の分子を標的とするキナーゼ阻害剤は、より回りくどい方法でGap1の活性化と発現に影響を与える。例えば、PP2はSrcキナーゼを阻害し、SrcキナーゼはGap1の活性化のためにGap1をリン酸化する。同様に、U0126とPD98059はMEKを阻害し、その結果ERK経路が減衰することでGap1の転写が減少する。これらの阻害剤は、関連する生化学的経路を異なる時点で撹乱することにより作用し、Gap1の構造的完全性を変化させることなく、Gap1の機能を効果的に調節することにつながる。
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