Los activadores de FBXO33 funcionan a través de varios mecanismos bioquímicos para potenciar su actividad en el sistema ubiquitina-proteasoma. Un activador estimula directamente la adenilato ciclasa, provocando un aumento de los niveles de AMPc, que es un segundo mensajero conocido por potenciar la actividad de ubiquitinación al promover la asociación de FBXO33 con sus sustratos. Al mismo tiempo, la inhibición de GSK-3 beta da lugar a la estabilización de proteínas que interactúan con FBXO33, aumentando potencialmente la eficacia del complejo SCF(FBXO33) en la selección de sustratos para su degradación. Los inhibidores del proteasoma contribuyen a este proceso induciendo la acumulación de proteínas poliubiquitinadas, lo que a su vez aumenta la necesidad de la función de ubiquitinación de FBXO33. Además, la activación de vías cinasas específicas por compuestos como la insulina conduce a la fosforilación de proteínas que pueden servir de sustratos, aumentando así las capacidades de reconocimiento y ubiquitinación de FBXO33.
Otras moléculas influyen en la funcionalidad de FBXO33 modulando el estado de fosforilación de las proteínas mediante la inhibición de las proteínas fosfatasas, lo que conduce a un aumento del conjunto de proteínas disponibles para la ubiquitinación. Los cambios en los niveles de calcio intracelular también pueden afectar a la actividad de las enzimas dependientes de calcio y a las vías de señalización, lo que puede potenciar indirectamente el proceso de ubiquitinación mediado por FBXO33. Del mismo modo, la modulación de la concentración intracelular de iones metálicos, la inhibición de la síntesis proteica y la interferencia con las chaperonas moleculares contribuyen a alterar la red de interacción proteica, afectando así a la actividad ubiquitina ligasa de FBXO33. Los inhibidores de las sirtuinas y de las histonas desacetilasas modifican el paisaje de acetilación de las proteínas, alterando potencialmente su susceptibilidad al reconocimiento por FBXO33.
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