このキナーゼは様々な基質をリン酸化し、FAHD2Bの活性を支配するタンパク質に影響を与える可能性がある。もう一つの活性化因子であるイオノマイシンは、細胞内のカルシウムバランスを崩し、カルシウム依存性キナーゼを活性化する。これらのキナーゼは次に多くのタンパク質をリン酸化するが、そのうちのいくつかはFAHD2B活性の調節に関与している可能性がある。PMAのようなホルボールエステルは、細胞内シグナル伝達の重要な担い手であるプロテインキナーゼCを刺激する。PKCは様々なタンパク質をリン酸化するが、この作用はFAHD2Bと相互作用するタンパク質にまで及び、その活性に影響を及ぼす可能性がある。対照的に、U0126やPD98059のような化合物は、MAPK/ERK経路の重要な構成要素であるMEK1/2を特異的に阻害し、FAHD2Bの活性に影響を与える可能性のあるリン酸化状況の変化をもたらす。
岡田酸やカリクリンAのようなプロテインホスファターゼ阻害剤は、脱リン酸化を防ぎ、FAHD2Bの機能に影響を与えうるリン酸化状態のタンパク質を維持する。エピガロカテキンガレートのようなフラボノイドやレスベラトロールのようなスチルベノイドは、様々なシグナル伝達経路に関与し、FAHD2Bに関連するタンパク質の活性を変化させる可能性がある。スペルミンに代表されるポリアミンは、細胞の恒常性を調節し、間接的にFAHD2Bに影響を与える可能性がある。さらに、塩化リチウムは複数の基質を持つキナーゼであるGSK-3に作用し、ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤である酪酸ナトリウムは遺伝子発現パターンを変化させるが、これらはいずれもFAHD2B活性の変化につながる可能性がある。
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