La classe chimique désignée sous le nom d'inhibiteurs du DnaJC11 englobe une gamme variée de composés qui peuvent interférer avec diverses voies cellulaires, affectant ainsi indirectement l'expression fonctionnelle et les mécanismes de régulation de la protéine DnaJC11. Ces inhibiteurs comprennent des agents qui peuvent perturber la fonction mitochondriale, le repliement des protéines et les réponses au stress cellulaire, qui sont des processus critiques dans lesquels la protéine DnaJC11 est connue pour être impliquée. Les inhibiteurs ciblent ces processus par différents mécanismes, souvent sans rapport avec leurs cibles biologiques primaires, mais avec la capacité d'influencer l'environnement cellulaire du DnaJC11. L'oligomycine, par exemple, est un composé qui perturbe l'ATP synthase mitochondriale, cruciale pour la production d'ATP.
Cette perturbation peut conduire à un état énergétique cellulaire altéré, affectant les protéines dépendant de l'ATP, y compris celles associées à l'intégrité mitochondriale, comme le DnaJC11. De même, la cyclosporine A, qui module le pore de transition de perméabilité mitochondriale, peut également altérer la fonction mitochondriale, avec des ramifications potentielles sur les protéines associées aux mitochondries. Des composés comme la tunicamycine et la geldanamycine affectent le repliement des protéines et les réseaux de chaperons. La tunicamycine inhibe la glycosylation liée à l'azote, une modification post-traductionnelle essentielle au bon repliement de nombreuses protéines, affectant ainsi l'homéostasie des protéines et potentiellement le fonctionnement du DnaJC11. La geldanamycine et son dérivé, le 17-AAG, se lient à la Hsp90 et, en modulant sa fonction, peuvent altérer le réseau de protéines chaperonnes, ce qui pourrait avoir des effets en aval sur le rôle du DnaJC11 dans la même voie. En outre, il existe des agents comme la Brefeldine A et la Chloroquine qui perturbent respectivement le trafic intracellulaire et la fonction lysosomale. La Brefeldine A empêche l'échange de protéines entre le réticulum endoplasmique et l'appareil de Golgi, un processus essentiel au bon tri et au bon fonctionnement des protéines cellulaires.
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