フォルスコリンとジブチリル-CAMPは、細胞内のサイクリックAMP(cAMP)を上昇させ、その結果、プロテインキナーゼA(PKA)が活性化される。PKAの活性化は、複数の基質のリン酸化につながり、COG4を介した小胞輸送に影響を与える可能性がある。さらに、8-Bromo-cAMPのような化合物は、PKAを直接刺激するcAMPアナログとして機能し、細胞レセプターをバイパスするため、膜輸送におけるCOG4の役割を支配する経路に、より即効性を発揮する。イオノマイシンは、細胞内カルシウムレベルを上昇させる能力を通じて、COG4の制御機能と交差する可能性のあるカルシウム依存性のシグナル伝達カスケードを動かす。エピガロカテキンガレート(EGCG)のようなポリフェノールや、フォルボール12-ミリスチン酸13-アセテート(PMA)のようなフォルボールエステルは、プロテインキナーゼC(PKC)を活性化する。PKCシグナル伝達は、COG4の活性を調節する可能性のある一連のリン酸化事象を引き起こし、間接的にゴルジ由来の小胞の輸送と選別に影響を与える。
PI3K阻害剤であるLY294002は、MEKとヒストン脱アセチル化酵素をそれぞれ阻害するPD98059と酪酸ナトリウムとともに、様々なシグナル伝達経路と遺伝子発現プロファイルを変化させる。これらの変化はCOG4の機能を変化させ、COG4の活性を支配する細胞内シグナルの複雑な網の目を浮き彫りにする。レチノイン酸は、核内受容体を活性化することにより、ゴルジ体輸送プロセスに関連する遺伝子発現を調節することによって、COG4の機能にも影響を及ぼす可能性がある。シグナル伝達脂質であるD-エリスロ-スフィンゴシン-1-リン酸は、細胞内輸送の制御における脂質シグナルの複雑さを反映して、COG4の機能を調節する可能性のある経路を活性化する能力を持っている。幅広いシグナル伝達相互作用を持つクルクミンもまた、COG4の制御ネットワークに影響を与える可能性を秘めている。
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