Gli inibitori della claudina-11 comprendono una varietà di composti chimici che possono potenzialmente modulare la funzione e l'attività della claudina-11, direttamente o indirettamente, influenzando le vie biochimiche e i processi cellulari in cui la claudina-11 è coinvolta. La staurosporina, un potente inibitore delle protein-chinasi, ad esempio, può inibire la PKC, che è nota per regolare la funzione delle claudine, compresa la claudina-11. La riduzione dell'attività della PKC attraverso la staurosporina può portare a una minore fosforilazione della claudina-11, con conseguente destabilizzazione delle giunzioni strette, in cui la claudina-11 svolge un ruolo essenziale. Analogamente, LY294002 e Wortmannin, entrambi inibitori della PI3K, possono influenzare la funzione della claudina-11 riducendo l'attività di Akt, che ha una nota influenza sulla claudina-11 e sull'integrità delle giunzioni strette. PD98059 e U0126, inibitori selettivi di MEK, possono inibire la via MAPK/ERK, che è parte integrante della funzione della claudina-11 nella trasduzione del segnale mediata da ERK nelle giunzioni strette. Anche l'inibitore di JNK SP600125 e l'inibitore della chinasi della famiglia Src PP2 dimostrano un potenziale di modulazione della funzione della claudina-11, in quanto queste chinasi partecipano attivamente alla regolazione di quest'ultima.
L'inibitore di ROCK Y-27632 è un altro composto degno di nota, con la sua capacità di influenzare la claudina-11 inibendo la via RhoA/ROCK, un regolatore critico delle giunzioni strette. Analogamente, SB431542, un inibitore del recettore ALK5, può influenzare la funzione della claudina-11 attraverso il suo impatto sulla via di segnalazione TGF-β. Altre due sostanze chimiche di questa classe, la wiskostatina e il BAPTA, esercitano la loro influenza attraverso meccanismi diversi. La wiskostatina, un inibitore di N-WASP, può interferire con la funzione della claudina-11 inibendo N-WASP, noto per regolare le giunzioni strette attraverso il suo ruolo nel rimodellamento del citoscheletro di actina. Il BAPTA, un chelante del calcio, può inibire la claudina-11 chelando il calcio, elemento critico per la funzione delle giunzioni strette e della claudina-11. Infine, la genisteina, un inibitore della tirosin-chinasi, può influenzare la claudina-11 inibendo le tirosin-chinasi, che sono note regolatrici della funzione della claudina-11.
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