CAPS2の化学的活性化因子は、様々な手段で小胞輸送と神経伝達物質放出におけるその機能を増強する。フォルボール12-ミリスチン酸13-アセテート(PMA)はプロテインキナーゼC(PKC)の活性化因子として機能し、CAPS2のリン酸化につながり、シナプス小胞のプライミングとエキソサイトーシスにおける役割を促進する。同様に、フォルスコリンは細胞内のcAMPレベルを上昇させ、その後、CAPS2のようなタンパク質をリン酸化することで知られるプロテインキナーゼA(PKA)を活性化し、その活性化を促進する。カルシウムイオノフォアであるイオノマイシンとA23187は、カルシウム依存性のエキソサイトーシスに重要な役割を果たすため、CAPS2の活性化の鍵となる細胞内カルシウムレベルを上昇させる。さらに、ブレフェルジンAはゴルジ装置の構造と機能を破壊し、小胞の輸送と再利用の要求が増大するため、間接的にCAPS2の活性が亢進すると考えられる。
タプシガルギンは、SERCAポンプを阻害することにより、細胞質カルシウムを上昇させ、カルシウムを介した小胞放出過程に関与しているため、CAPS2の活性化につながる可能性がある。タプシガルギンと同様に、N6-ベンゾイルアデノシン-3',5'-環状一リン酸とジブチリル-cAMPは、PKAを刺激するcAMPアナログであり、CAPS2をリン酸化して活性化することができる。ジアシルグリセロールの合成アナログであるDiC8は、PKCを活性化し、CAPS2のリン酸化と活性化をもたらす可能性がある。オカダ酸とカリクリンAはともにタンパク質リン酸化酵素PP1とPP2Aを阻害し、CAPS2の脱リン酸化を防いで活性化状態を維持すると考えられる。最後に、小胞膜の構成成分であるホスファチジルセリンは、CAPS2の活性化を助長する膜動態とシグナル伝達経路に影響を与え、小胞融合の機能制御におけるその重要性を強調している。
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