フォルスコリンは、細胞内のcAMPレベルを上昇させる能力で有名です。このcAMPの上昇は、プロテインキナーゼA(PKA)を活性化する。PKAは、広範な基質をリン酸化する重要な酵素であり、多数の細胞プロセスを指揮する。同様に、イオノマイシンは、細胞内カルシウム濃度を上昇させる能力を通じて、カルシウム依存性キナーゼが関与する事象のカスケードを引き起こし、それによって細胞内コミュニケーションと代謝に不可欠なタンパク質活性に影響を与える。
PMAとして知られる強力な活性化因子は、活性化因子ジアシルグリセロール(DAG)を模倣し、プロテインキナーゼC(PKC)に強力に関与する。この相互作用により、PKC傘下の様々なタンパク質がリン酸化され、その機能が著しく変化する。EGF(上皮成長因子)やインスリンなどの成長因子は、その特異的レセプターと相互作用して一連の下流シグナル伝達を開始し、最終的に細胞の成長、生存、分化を制御するタンパク質を活性化する。カリクリンAやオカダ酸のような化合物は、PP1やPP2Aのようなタンパク質リン酸化酵素を阻害することによって作用する。この阻害は、タンパク質からリン酸基が除去されるのを防ぎ、それによってタンパク質をリン酸化された、しばしばより活性の高い状態に維持する。U0126やLY294002のようなキナーゼ阻害剤もまた、それぞれMEKやPI3Kの作用を特異的に阻害することによって、重要な役割を果たしている。これらの阻害剤は、これらのキナーゼによって制御されるシグナル伝達経路に多大な影響を及ぼし、細胞の重要な機能に関与するタンパク質のネットワークに影響を与える。
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