La classe degli inibitori di C20orf3 comprende sostanze chimiche che mirano a più vie cellulari, che possono influenzare la proteina direttamente o indirettamente. LY294002 e Wortmannin, inibitori della PI3K, agiscono bloccando la via di segnalazione di Akt. Se C20orf3 è un effettore a valle di Akt, queste sostanze chimiche ne inibiscono l'attività. Analogamente, l'inibitore di MEK1/2 U0126 e l'inibitore di ERK PD98059 si concentrano sulla via MAPK. Se C20orf3 dovesse essere attivato o regolato da ERK, questi inibitori bloccheranno questa interazione. L'impatto dell'attività delle chinasi su C20orf3 può essere alterato anche da Staurosporine, un inibitore non specifico delle chinasi, e da SP600125, un inibitore di JNK. Questi inibitori bloccano i processi di fosforilazione e modificazione chinasi-dipendenti, che possono coinvolgere C20orf3.
D'altra parte, Y-27632 e Blebbistatina agiscono sulla dinamica cellulare inibendo ROCK e la miosina II. Se C20orf3 ha un ruolo nella motilità o nella localizzazione cellulare, questi inibitori influiranno su questo aspetto. In un altro modo, IWP-2 blocca la secrezione di Wnt e può quindi sopprimere C20orf3 se fa parte della via di segnalazione Wnt. Gli inibitori della fosfatasi, come la calicolina A e l'acido okadaico, offrono un altro livello di controllo, influenzando lo stato di fosforilazione delle proteine. Se C20orf3 richiede una fosforilazione specifica per la sua attivazione o funzione, questi inibitori interromperanno tale processo. Infine, la rapamicina blocca mTOR, influenzando così le vie di sintesi proteica, e sopprime l'espressione di C20orf3 se è sintetizzato in modo mTOR-dipendente.
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