ロリプラム、ゲニステイン、SB203580といった化合物は、それぞれPDE4、チロシンキナーゼ、p38 MAPKといった異なるキナーゼや酵素を特異的に標的とする。これらの相互作用は、タンパク質のリン酸化状態を変化させる細胞内イベントのカスケードを引き起こし、その結果、タンパク質の機能を変化させる可能性がある。MG132によるプロテアソーム分解の阻害は、タンパク質の蓄積につながり、細胞内のタンパク質のターンオーバー速度や定常状態に影響を及ぼす可能性がある。
KN-93、PD0325901、U0126、ZM-447439は、カルシウムシグナル伝達、MAPK/ERK経路、細胞分裂制御に不可欠なCaMKII、MEK、オーロラキナーゼなどの主要な制御酵素を標的とする。これらの経路は、タンパク質の活性制御や様々な刺激に対する細胞応答にとって極めて重要である。LY294002とSP600125は、それぞれPI3K/ACT経路とJNK経路に作用し、細胞の生存、増殖、ストレス応答などのプロセスに影響を及ぼす。Y-27632とAICARは、ROCKの阻害とAMPKの活性化を通して、細胞骨格の組織化とエネルギー代謝に影響を与える。これらの活性は、広範なタンパク質の活性の変化を含む、細胞機能への広範な影響をもたらす可能性がある。
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