Gli inibitori delle chinasi, come la staurosporina, sono noti per la loro attività di inibizione delle chinasi ad ampio spettro e possono alterare lo stato di fosforilazione di numerose proteine. Analogamente, LY294002 e U0126 sono inibitori specifici rispettivamente di PI3K e MEK1/2 e, inibendo queste chinasi, possono modulare la segnalazione a valle che coinvolge le vie Akt ed ERK, fondamentali per numerosi processi cellulari, compresi quelli legati alla funzione e all'espressione delle proteine.
Altri inibitori come la rapamicina e il bortezomib agiscono inibendo rispettivamente mTOR e il proteasoma. L'inibizione di mTOR da parte della rapamicina può determinare una riduzione della sintesi proteica, mentre il bortezomib può portare a un accumulo di proteine a causa della riduzione della degradazione. Il ruolo della ciclopamina nell'inibire la via Hedgehog può influenzare la differenziazione e la proliferazione cellulare, mentre PD0325901, simile a U0126, può inibire specificamente MEK e influenzare l'attività della via ERK. Sostanze chimiche come SP600125 e ZM-447439 sono coinvolte nell'inibizione della via JNK e delle chinasi Aurora, rispettivamente, influenzando potenzialmente vari aspetti della segnalazione e della divisione cellulare. Il CNQX, modulando la trasmissione sinaptica, può influenzare le vie di segnalazione neuronale.
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