Os inibidores químicos da BIN2 abrangem uma gama de compostos que podem impedir a atividade cinase da proteína através de uma variedade de mecanismos. A esturosporina, o K252a e a 5-Iodotubercidina são notáveis pela sua capacidade de competir com o ATP pelo local ativo da BIN2, impedindo eficazmente a transferência de grupos fosfato para as proteínas do substrato. A esturosporina consegue isto com elevada potência, enquanto a especificidade do K252a em relação ao domínio da cinase é digna de nota, e as propriedades inibidoras da adenosina cinase da 5-Iodotubercidina contribuem para a sua atividade contra a BIN2. Do mesmo modo, o H-89 e o RO-31-8220 actuam obstruindo o local de ligação do ATP na BIN2, que é essencial para a sua função catalítica. O Gö 6983, embora reconhecido como um inibidor da pan-quinase, também demonstra a capacidade de impedir a BIN2 competindo com o ATP, impedindo assim a fosforilação de alvos a jusante.
Além disso, o LY294002 e a Wortmannin, tradicionalmente classificados como inibidores da PI3K, também podem inibir a BIN2 através da inibição competitiva no local de ligação ao ATP, com a Wortmannin a formar uma ligação covalente no domínio da quinase que bloqueia o acesso do ATP. O PD 98059, embora seja principalmente um inibidor da MEK, pode interferir com cinases na mesma via de sinalização que a BIN2, reduzindo assim a atividade cinase da BIN2 através de um efeito de cascata. O SB 203580 e o SP600125, que, ao visarem a p38 MAP quinase e a JNK, respetivamente, inibem indiretamente o BIN2 através da perturbação de vias de sinalização relacionadas que são essenciais para a ativação do BIN2, fazem o mesmo. A bisindolilmaleimida I completa esta lista com a sua ação sobre a proteína quinase C, que também partilha semelhanças mecanicistas com a BIN2, permitindo-lhe inibir a BIN2 através da inibição competitiva no seu local de ligação ao ATP.
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