ATP9BL2は、ATPase Phospholipid Transporting 9B Like 2としても知られるタンパク質で、リン脂質輸送性ATPaseのP4-ATPaseサブファミリーに属すると考えられている。これらのタンパク質は、細胞膜の外葉から内葉へとリン脂質を反転させることに特化した膜タンパク質であり、脂質二重層におけるリン脂質の非対称分布を維持するために重要なプロセスである。
ATP9BL2の特異的な機能は、P4-ATPaseファミリーの他のメンバーほど解明されていないが、類推するに、膜脂質の組成と非対称性に依存する細胞内プロセスに関与している可能性が高い。そのようなプロセスには、小胞形成、細胞分裂、膜の完全性の維持などがある。ATP9BL2は、ATPを結合して加水分解する触媒ドメイン、基質の移動経路を形成する膜貫通ドメイン、酵素の活性を調節する調節領域など、P型ATPアーゼに典型的な構造を持っていると考えられる。リン酸化と脱リン酸化は、リン酸化された酵素中間体の形成を伴う輸送メカニズムの中心である。
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