Os inibidores químicos do AGP-3 funcionam através de várias vias celulares, visando enzimas e cinases específicas que estão a montante ou fazem parte das cascatas de sinalização essenciais para a atividade do AGP-3. Por exemplo, a Wortmannin e o LY294002 são inibidores da fosfoinositídeo 3-quinases (PI3K). A PI3K é fundamental para a ativação de várias proteínas a jusante, incluindo o AGP-3. Ao inibir a PI3K, estes produtos químicos impedem a formação de fosfatidilinositol (3,4,5)-trisfosfato, um mensageiro secundário necessário para a ativação do AGP-3. A rapamicina tem como alvo a via mTOR, que é um regulador central do crescimento e da proliferação celular. Se o AGP-3 depende da sinalização mTOR para a sua função, a rapamicina pode inibir o AGP-3 ao perturbar a síntese proteica e os processos de autofagia que o mTOR controla. Do mesmo modo, o SB203580 e o PD98059 inibem a quinase MAP p38 e a MEK, respetivamente. Estas cinases fazem parte da via MAPK, que está frequentemente implicada na regulação da função proteica. Ao inibir estas cinases, o SB203580 e o PD98059 impedem os eventos de fosforilação necessários que normalmente conduziriam à ativação do AGP-3.
Além disso, o U0126, um inibidor seletivo da MEK1 e da MEK2, e o SP600125, um inibidor da JNK, também interrompem a via de sinalização da MAPK, impedindo assim a ativação do AGP-3. A triciribina inibe diretamente a Akt, uma quinase que está envolvida em numerosos processos celulares. Se o AGP-3 funcionar a jusante da Akt, a inibição da Akt pela triciribina resultaria na supressão da atividade do AGP-3. O Stattic actua inibindo a ativação e a dimerização do STAT3, um fator de transcrição. Se a atividade do AGP-3 for regulada pelo STAT3, o Stattic inibiria o AGP-3 ao impedir a necessária atividade de transcrição. O NSC 23766 tem como alvo a Rac1, uma GTPase que, quando inibida, interromperia as vias de sinalização dependentes da Rac1, cruciais para o AGP-3. O BAY 11-7082 inibe o NF-κB, um fator de transcrição que regula a expressão de vários genes, incluindo os necessários para a função do AGP-3. Ao bloquear a fosforilação do IκBα, o BAY 11-7082 impede o NF-κB de ativar os genes necessários para a atividade do AGP-3. Por último, o CCG-1423 inibe a sinalização transcricional mediada por RhoA, que, se envolvida na regulação do AGP-3, resultaria na inibição do AGP-3 devido ao bloqueio dos efeitos de transcrição do gene RhoA.
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