Os inibidores químicos que podem influenciar indiretamente a atividade da DIPK2B são diversos na sua estrutura e especificidades. Embora não sejam inibidores directos da DIPK2B, a sua capacidade de modular a atividade da quinase pode ter impacto na rede funcional da DIPK2B. Estes compostos variam entre inibidores de quinase de largo espetro, como a estauroporina, que se pode ligar a uma grande variedade de quinases devido à sua interação com os locais de ligação ao ATP, e inibidores mais específicos que afectam nós-chave nas vias de sinalização, como os inibidores da PI3K (wortmannin e LY294002), o inibidor da mTOR (rapamicina) e os inibidores múltiplos da tirosina quinase (dasatinib, erlotinib, sorafenib, sunitinib e imatinib).
Outros compostos listados concentram-se na via MAPK, que desempenha um papel crítico na transdução de sinais extracelulares para respostas intracelulares. O U0126 é um inibidor específico da MEK1/2, o SB203580 tem como alvo a p38 MAP quinase e o SP600125 inibe a JNK. Ao interferir com estas cinases, os compostos podem afetar o estado de fosforilação de vários substratos, conduzindo a respostas celulares alteradas. O impacto na atividade da DIPK2B, se existir, resultaria de alterações no meio de sinalização celular, possivelmente afectando o estado de fosforilação da proteína, a sua localização ou a interação com outros componentes celulares.
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