La classe chimica denominata Inibitori di Wdr95 comprende composti che influenzano indirettamente la funzione di Wdr95 modulando vari meccanismi cellulari e vie di segnalazione. Il Withaferin A, ad esempio, è noto per interrompere le interazioni proteina-proteina, che possono influenzare l'assemblaggio di complessi proteici che coinvolgono Wdr95. La geldanamicina, legandosi a Hsp90, potrebbe destabilizzare le proteine clienti, comprese quelle con domini WD40, alterando così lo stato funzionale di Wdr95. Composti come la curcumina hanno ampi effetti sulla segnalazione cellulare e possono modificare l'attività o la stabilità di Wdr95 all'interno di tali percorsi.
D'altra parte, l'ivermectina e la rifampicina, con i loro rispettivi meccanismi, possono perturbare le interazioni proteina-ligando o la sintesi proteica, che a loro volta possono avere implicazioni per la funzionalità di Wdr95. Anche i diversi effetti della clorpromazina potrebbero portare a un'alterazione dell'attività di Wdr95. U-0126 e LY294002 hanno come bersaglio chinasi specifiche all'interno di vie di segnalazione critiche e, pertanto, possono esercitare un'influenza sul ruolo di Wdr95 in queste vie. La tricostatina A e l'MG-132 agiscono modulando l'espressione genica e il turnover proteico, rispettivamente, e potrebbero quindi influenzare i livelli di espressione o la degradazione di Wdr95. La rapamicina e la Wnt-C59 alterano le vie di crescita e di segnalazione a cui Wdr95 può partecipare, influenzandone potenzialmente l'attività o l'espressione.
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