SSRP1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-401780

Panoramica

SSRP1 (Structure Specific Recognition Protein 1) è una subunità essenziale del complesso di rimodellamento della cromatina FACT, che facilita lo smontaggio e il riassemblaggio dei nucleosomi durante la trascrizione, la replicazione del DNA e la riparazione del DNA. Coordinando l’attività di chaperone degli istoni con l’avanzamento della RNA polimerasi II e con la dinamica della forcella replicativa, SSRP1 contribuisce a mantenere la stabilità del genoma e a regolare l’accessibilità della cromatina. I processi dipendenti da SSRP1 si intrecciano con il controllo del ciclo cellulare, le risposte al danno al DNA e la regolazione epigenetica, rendendolo rilevante per studi sullo stress replicativo e su programmi trascrizionali aberranti. Un’attività deregolata di FACT/SSRP1 è stata implicata in stati oncogenici della cromatina e in un’alterata capacità proliferativa, supportandone l’uso come nodo meccanicistico nella biologia del cancro e nella ricerca sulla manutenzione del genoma.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO SSRP1 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene SSRP1 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del SSRP1 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto SSRP1 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina SSRP1.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di SSRP1 per lo studio della segnalazione di SSRP1, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni SSRP1 critici per la funzione di SSRP1
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di SSRP1 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal SSRP1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal SSRP1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus SSRP1. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal SSRP1 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR SSRP1 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia SSRP1 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio SSRP1 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.