PHF6 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (m): sc-427858

Panoramica

Il gene murino **Phf6** codifica **PHF6**, una proteina nucleare con dominio a dita di zinco di tipo PHD-like che agisce come regolatore della trascrizione e della biogenesi dell’RNA associato alla cromatina. PHF6 partecipa al controllo epigenetico dell’espressione genica attraverso interazioni con complessi di rimodellamento della cromatina e di modifica degli istoni, influenzando programmi trascrizionali specifici di linea, la progressione del ciclo cellulare e la differenziazione. L’alterazione delle reti regolatorie dipendenti da PHF6 è stata collegata a processi ematopoietici e di neurosviluppo modificati, rendendo **Phf6** un nodo utile per lo studio della disregolazione trascrizionale. Nei modelli murini, la perturbazione di **Phf6** viene comunemente analizzata nel contesto della stabilità genomica, dell’organizzazione della cromatina e di firme di espressione genica rilevanti per la malattia.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO PHF6 (m) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene Phf6 in linee cellulari mouse. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del Phf6 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto Phf6 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina PHF6.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di Phf6 per lo studio della segnalazione di PHF6, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni Phf6 critici per la funzione di PHF6
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di Phf6 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal PHF6 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m) e dal PHF6 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus Phf6. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal PHF6 Plasmide HDR (m) e il plasmide HDR PHF6 (m2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia Phf6 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio Phf6 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.