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PADI2 Plasmide di attivazione CRISPR (h) | sc-403349-ACT | 20 µg | $397.00 |
La peptidil arginina deiminasi 2 (PADI2) è un enzima calcio-dipendente che catalizza la citrullinazione dei residui di arginina delle proteine, alterandone carica, struttura e reti di interazione. Questa modificazione post-traduzionale regola l’accessibilità della cromatina e l’espressione genica attraverso la citrullinazione degli istoni e può rimodellare proteine del citoscheletro e associate alla mielina, collegando PADI2 alla differenziazione e alla segnalazione infiammatoria. L’attività di PADI2 interseca programmi trascrizionali influenzati da vie indotte da citochine ed è stata studiata in contesti di regolazione epigenetica aberrante, danno tissutale immuno-mediato e fenotipi associati ai tumori. La citrullinazione disregolata e la generazione di neoepitopi implicano PADI2 in meccanismi rilevanti per l’autoimmunità e la biologia del cancro, supportandone l’uso come nodo molecolare per l’interrogazione di pathway.
PADI2 Il plasmide di attivazione CRISPR (h) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di PADI2 senza alterare la sequenza di DNA sottostante.
PADI2 Il plasmide di attivazione CRISPR (h) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus PADI2 nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.
Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione PADI2, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di PADI2. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus PADI2 nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da PADI2 nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via PADI2 nelle cellule tumorali con espressione di PADI2 silenziata o ridotta.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.