GATAD1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-403468

Panoramica

GATAD1 (GATA zinc finger domain containing 1) codifica una proteina nucleare associata alla cromatina, implicata nella regolazione trascrizionale tramite legame al DNA e interazioni proteina–proteina. Attraverso il suo dominio a dito di zinco, GATAD1 è collegato al controllo di programmi di espressione genica che influenzano la proliferazione cellulare, la differenziazione e le risposte adattative allo stress, spesso in coordinamento con modificatori epigenetici e complessi di rimodellamento della cromatina. Alterazioni dell’espressione o del numero di copie di GATAD1 sono state riportate in molteplici contesti tumorali, alimentando l’interesse per il suo contributo a stati trascrizionali oncogenici e a perturbazioni delle reti regolatorie a livello genomico. Di conseguenza, GATAD1 è comunemente studiato nell’ambito dei meccanismi di regolazione della cromatina, dei circuiti dei fattori di trascrizione e del cross-talk tra vie di segnalazione rilevanti per il cancro.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO GATAD1 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene GATAD1 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del GATAD1 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto GATAD1 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina GATAD1.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di GATAD1 per lo studio della segnalazione di GATAD1, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni GATAD1 critici per la funzione di GATAD1
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di GATAD1 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal GATAD1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal GATAD1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus GATAD1. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal GATAD1 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR GATAD1 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia GATAD1 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio GATAD1 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.