Date published: 2026-7-21

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CTCF Plasmide Double Nickase (h): sc-401245-NIC

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Schede Tecniche
  • Specie Target: human
  • 20 µg di DNA plasmidico purificato, pronto per trasfezione; sufficiente fino a 20 trasfezioni
  • CTCF Plasmide Double Nickase (h) consiste in un paio di plasmidi ciascuno codificante una nucleasi Cas9 mutata D10A ed un RNA guida (gRNA) di 20 nt target specifico, disegnato per il silenziamento dell'espressione genica con una maggiore specificità rispetto alla controparte CRISPR/Cas9 KO
  • Le sequenze di gRNA appaiate sono offset di circa 20 bp per permettere lo specifico doppio nicking Cas9 mediato che mima un DSB
  • Un plasmide dei due contiene un gene per la resistenza alla puromicina per la selezione; l'altro plasmide nella coppia contiene un marker GFP per confermare la trasfezione visivamente.
  • Il CTCF Double Nickase Plasmid (h) e il CTCF Double Nickase Plasmid (h2) codificano per distinti design di gRNA accoppiati che prendono di mira CTCF. Uno o entrambi i design potrebbero essere disponibili
  • In seguito alla trasfezione, l'efficienza dll'attivazione genica può essere testata con WB, IF o IHC utilizzando l'anticorpo: CTCF Antibody (G-8): sc-271474
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    CTCF Plasmide Double Nickase (h)

    sc-401245-NIC
    20 µg
    $410.00

    CTCF Plasmide Double Nickase (h2)

    sc-401245-NIC-2
    20 µg
    $410.00

    CTCF codifica il fattore legante CCCTC, una proteina multifunzionale a dita di zinco che si lega al DNA e organizza l’architettura tridimensionale del genoma stabilendo confini della cromatina e regolando la comunicazione tra enhancer e promotori. Collabora con la coesina per formare e mantenere i domini di associazione topologica (TAD), influenzando il controllo trascrizionale, la tempistica di replicazione e le risposte al danno al DNA. Attraverso meccanismi di isolamento e looping a lunga distanza, CTCF modula programmi di espressione genica specifici di linea cellulare e il mantenimento degli stati epigenetici. Alterazioni della funzione di CTCF o del suo panorama di legame sono associate a una disorganizzazione della cromatina osservata in disturbi dello sviluppo e in diversi tipi di cancro, rendendolo un nodo ampiamente utilizzato per studiare la regolazione genica legata alla topologia del genoma.

    CTCF Il plasmide Double Nickase (h) consiste in una coppia di plasmidi ingegnerizzati per l'editing ad alta specificità del locus CTCF nelle linee cellulari human. Ciascun plasmide esprime una nickasi Cas9 D10A e un sgRNA distinto che prende di mira filamenti di DNA opposti all'interno di CTCF. Quando indirizzate verso siti adiacenti su filamenti di DNA opposti, le due nickasi generano tagli a filamento singolo sfalsati che insieme producono una rottura a doppio filamento sfalsata, richiedendo un'attività coordinata sul bersaglio da entrambe le guide. La rottura del DNA risultante viene risolta da vie di riparazione cellulare endogene, più comunemente attraverso la giunzione non omologa delle estremità (NHEJ), portando a inserzioni o delezioni che interrompono la funzione di CTCF. Richiedendo il coinvolgimento di due sgRNA nel locus bersaglio, l'approccio a doppia nickasi migliora la specificità dell'editing e fornisce una strategia CRISPR complementare per applicazioni in cui è desiderato un controllo aggiuntivo sulla precisione del targeting.

    Per supportare l'identificazione efficiente delle cellule modificate, un plasmide codifica la GFP per la visualizzazione fluorescente delle popolazioni trasfettate, mentre il plasmide di accompagnamento porta un gene di resistenza alla puromicina per la selezione antibiotica. Insieme, queste caratteristiche supportano l'arricchimento efficiente delle popolazioni co-trasfettate e semplificano la convalida dei cloni con CTCF interrotto.

    Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.