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USF-1 Plasmide di attivazione CRISPR (m) | sc-423628-ACT | 20 µg | $397.00 |
Il fattore stimolatorio a monte 1 (Upstream stimulatory factor 1, Usf1) codifica il fattore di trascrizione USF-1, una proteina bHLH-LZ (basic helix–loop–helix leucine zipper) che si lega ai motivi E-box per coordinare programmi di espressione genica che controllano il metabolismo cellulare, la differenziazione e le risposte allo stress. Nelle cellule murine, USF-1 integra segnali nutrizionali e ormonali per regolare l’omeostasi di lipidi e glucosio, le vie mitocondriali e ossidative e le reti trascrizionali associate al ritmo circadiano. Attraverso la sua attività a livello di promotori ed enhancer, USF-1 influenza l’accessibilità della cromatina e l’output trascrizionale nei tessuti metabolici e in contesti rilevanti per il sistema immunitario. Un’attività deregolata di USF1/USF-1 è stata collegata a fenotipi cardiometabolici, tra cui alterazioni nella gestione delle lipoproteine e nella sensibilità all’insulina, supportandone l’impiego in studi meccanicistici sulla biologia delle malattie metaboliche.
USF-1 Il plasmide di attivazione CRISPR (m) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di Usf1 senza alterare la sequenza di DNA sottostante.
USF-1 Il plasmide di attivazione CRISPR (m) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus Usf1 nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.
Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione Usf1, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di USF-1. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus Usf1 nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da USF-1 nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via USF-1 nelle cellule tumorali con espressione di Usf1 silenziata o ridotta.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.