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SSX5 Plasmide di attivazione CRISPR (h) | sc-403552-ACT | 20 µg | $397.00 |
SSX5 (sinovial sarcoma, punto di rottura X 5) codifica una proteina nucleare simile agli antigeni cancro-testis, implicata nella regolazione trascrizionale e in processi associati alla cromatina. I membri della famiglia SSX possono interagire con regolatori epigenetici, inclusi i complessi del gruppo Polycomb, influenzando programmi di espressione genica legati all’identità cellulare e al controllo della proliferazione. Un’espressione aberrante di SSX5 è stata riportata in diversi contesti tumorali ed è spesso studiata nell’ambito degli oncogeni di fusione associati a SSX e della biologia degli antigeni in immuno-oncologia. Di conseguenza, SSX5 viene utilizzato come modello per indagare la disregolazione trascrizionale, l’espressione di antigeni ristretta a specifiche linee cellulari e le reti regolatorie associate ai tumori.
SSX5 Il plasmide di attivazione CRISPR (h) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di SSX5 senza alterare la sequenza di DNA sottostante.
SSX5 Il plasmide di attivazione CRISPR (h) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus SSX5 nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.
Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione SSX5, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di SSX5. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus SSX5 nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da SSX5 nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via SSX5 nelle cellule tumorali con espressione di SSX5 silenziata o ridotta.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.