SNRPC Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-404002

Panoramica

SNRPC codifica una componente centrale delle proteine Sm della piccola ribonucleoproteina nucleare U1 (snRNP), un sottocomplesso essenziale dello spliceosoma che riconosce i siti di splicing 5′ e promuove uno splicing accurato del pre-mRNA. Attraverso l’assemblaggio delle particelle snRNP e la stabilizzazione delle interazioni tra U1 snRNA e le proteine, SNRPC sostiene la biogenesi dello spliceosoma, la maturazione dell’RNA co-trascrizionale e i programmi di espressione genica a valle. L’alterazione di componenti dello spliceosoma, incluso SNRPC, è associata a una diffusa deregolazione dello splicing, che può influenzare il controllo del ciclo cellulare, le risposte al danno al DNA e i percorsi di differenziamento. Una funzione anomala dello spliceosoma è stata collegata a diverse malattie umane, in particolare a tumori e a patologie ereditarie guidate da un’elaborazione aberrante dell’RNA.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO SNRPC (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene SNRPC in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del SNRPC insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto SNRPC a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina SNRPC.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di SNRPC per lo studio della segnalazione di SNRPC, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni SNRPC critici per la funzione di SNRPC
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di SNRPC per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal SNRPC CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal SNRPC CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus SNRPC. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal SNRPC Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR SNRPC (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia SNRPC per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio SNRPC definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.