NFXL1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-407389

Panoramica

NFXL1 codifica un regolatore trascrizionale contenente domini a dito di zinco, implicato nel controllo di programmi di espressione genica legati alla differenziazione cellulare e alla segnalazione di risposta allo stress. In quanto presunto fattore di legame al DNA, ci si aspetta che NFXL1 influenzi reti trascrizionali che modellano processi epiteliali e immuno-correlati, incluse vie che governano il tono infiammatorio e la funzione di barriera. Studi genetici e funzionali nell’uomo hanno associato NFXL1 a fenotipi neuroevolutivi, supportandone la rilevanza per indagare la regolazione genica nel contesto dello sviluppo cerebrale e della funzione cognitiva. L’analisi degli output trascrizionali dipendenti da NFXL1 può aiutare a chiarire i bersagli a valle e il crosstalk tra vie di segnalazione che contribuiscono a stati di espressione complessi associati a malattia.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO NFXL1 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene NFXL1 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del NFXL1 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto NFXL1 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina NFXL1.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di NFXL1 per lo studio della segnalazione di NFXL1, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni NFXL1 critici per la funzione di NFXL1
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di NFXL1 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal NFXL1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal NFXL1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus NFXL1. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal NFXL1 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR NFXL1 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia NFXL1 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio NFXL1 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.