HoxC11 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-406796

Panoramica

HOXC11 codifica il fattore di trascrizione homeobox HoxC11, un regolatore che si lega al DNA e contribuisce alla definizione dell’asse antero-posteriore e dell’identità regionale durante lo sviluppo attraverso il controllo, specifico per sequenza, di programmi di espressione genica. Nei tessuti differenziati, HoxC11 può influenzare gli stati di differenziamento cellulare e le reti trascrizionali associate alla linea cellulare, interagendo con cofattori e con la macchina di regolazione della cromatina per modulare una trascrizione dipendente dal contesto. Un’espressione deregolata di HOXC11 è stata riportata in molteplici contesti tumorali ed è spesso studiata come parte di alterazioni più ampie delle reti di geni HOX che influenzano proliferazione, invasività e plasticità cellulare. In quanto regolatore trascrizionale, HoxC11 è rilevante per lo studio dei circuiti regolatori dello sviluppo, del controllo epigenetico dell’identità cellulare e della riprogrammazione oncogenica.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO HoxC11 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene HOXC11 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del HOXC11 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto HOXC11 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina HoxC11.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di HOXC11 per lo studio della segnalazione di HoxC11, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni HOXC11 critici per la funzione di HoxC11
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di HOXC11 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal HoxC11 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal HoxC11 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus HOXC11. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal HoxC11 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR HoxC11 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia HOXC11 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio HOXC11 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.