hnRNP E1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-423930

概要

Pcbp1は、Cリッチ配列を認識してmRNAの安定性および翻訳を制御するRNA結合タンパク質である、マウスのヘテロ核リボヌクレオタンパク質E1（hnRNP E1）をコードします。hnRNP E1は、細胞質における転写産物の利用可能性やリボソームでの翻訳を調整することで、細胞周期の進行、ストレス応答、分化に関連する転写後遺伝子制御に関与します。RNAプロセシングおよび翻訳制御における役割を通じて、hnRNP E1は上皮間葉転換、細胞骨格の再構築、シグナル依存的な遺伝子発現プログラムに関連する経路に影響を与えます。実験モデルでは、PCBP1/hnRNP E1活性の制御不全がRNA恒常性の変化や、腫瘍生物学および炎症性シグナル伝達に関連する表現型と関連づけられています。

hnRNP E1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるPcbp1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Pcbp1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Pcbp1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、hnRNP E1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、hnRNP E1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Pcbp1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• hnRNP E1の機能に不可欠なPcbp1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Pcbp1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• hnRNP E1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびhnRNP E1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Pcbp1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  hnRNP E1 HDRプラスミド（m）および hnRNP E1 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはPcbp1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のPcbp1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。