Sabe-se que o galato de epigalocatequina (EGCG) modula os estados de fosforilação de várias proteínas, podendo afetar a atividade da RNA polimerase III ao influenciar a sinalização celular. A forskolina é outro agente que, ao ativar a adenilil ciclase, aumenta os níveis intracelulares de cAMP, o que pode melhorar a função da RNA polimerase III através das vias de sinalização da proteína quinase dependente de cAMP (PKA). A ionomicina, um ionóforo de cálcio, aumenta os níveis de cálcio intracelular e pode ativar cascatas de sinalização dependentes do cálcio, o que pode ter um impacto indireto no POLR3K. O PMA ativa a proteína quinase C (PKC), que está envolvida na fosforilação de factores de transcrição e outras proteínas, modulando assim a atividade da RNA polimerase III. Isto sugere que a atividade do POLR3K pode ser influenciada pela via da PKC. Compostos como o SB 216763 inibem a glicogénio sintase quinase-3 (GSK-3), o que poderia potencialmente aumentar a síntese proteica e indiretamente aumentar a atividade do POLR3K.
Os inibidores da PI3K, como o LY 294002, interrompem as vias de sinalização a jusante que podem modular a atividade transcricional, afectando potencialmente o POLR3K. O PD 98059, um inibidor da MEK, também pode alterar as cascatas de sinalização que regulam a transcrição dos genes, influenciando assim a atividade do POLR3K. Do mesmo modo, a rapamicina, um inibidor da mTOR, provoca alterações nos sinais de crescimento celular que podem influenciar indiretamente a atividade do POLR3K. A Wortmannin, tal como o LY 294002, é um inibidor da PI3K que afecta o crescimento celular e a transdução de sinais de transcrição, o que pode influenciar o POLR3K. O U0126, um inibidor seletivo da MEK1/2, pode ter impacto na regulação dos factores de transcrição, o que, mais uma vez, pode afetar o POLR3K. Os moduladores epigenéticos, tais como a tricostatina A, um inibidor da histona desacetilase, e a 5-azacitidina, um inibidor da DNA metiltransferase, podem alterar a estrutura da cromatina e os padrões de metilação do DNA, respetivamente, influenciando a paisagem transcricional em que o POLR3K opera.
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