A U18666A afecta o tráfico de colesterol, um determinante crucial da formação do endossoma e do corpo multivesicular (MVB), exercendo assim uma influência na esfera operacional do MVB12B. O GW4869 perturba o metabolismo da esfingomielina, alterando a composição da membrana endossómica e criando um cenário em que a função do MVB12B está preparada para se ajustar em conformidade. A manumicina A, ao inibir a Ras farnesiltransferase, e a genisteína, através da sua ação sobre as tirosina-quinases, afectam o tráfego de proteínas e as vias de sinalização, o que pode ter ramificações no papel do MVB12B na triagem endossomal.
A bafilomicina A1 e a monensina modulam de forma única o equilíbrio do pH endossómico, uma alteração ambiental que pode tornar mais crítica a capacidade funcional do MVB12B. Do mesmo modo, ao inibir componentes-chave da endocitose, como o Pitstop 2 e o Inibidor de Dinamina I, Dynasore, a necessidade celular do envolvimento do MVB12B nos processos de tráfico pode ser acentuada. Os produtos químicos YM201636 e MLN4924, ao visarem a PIKfyve e a neddilação de proteínas, respetivamente, geram perturbações no metabolismo dos fosfoinositídeos e nos padrões de ubiquitinação, promovendo condições que podem necessitar de uma maior atividade do MVB12B. A cloroquina, vulgarmente conhecida pelos seus efeitos na função dos lisossomas autofágicos, apresenta um cenário em que os mecanismos compensatórios que envolvem o MVB12B podem ser activados para garantir a separação adequada da carga nos MVB. A ligação da filipina III ao colesterol pode ser vista como uma perturbação da integridade da jangada lipídica, o que é suscetível de ter efeitos a jusante sobre os mecanismos de triagem endossómica, potencialmente destacando o papel funcional do MVB12B no âmbito destes processos.
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