Os activadores químicos do cluster 1 da histona H2B actuam principalmente através da inibição das histona desacetilases (HDAC), que são enzimas que removem os grupos acetilo das proteínas histonas, conduzindo a uma estrutura de cromatina mais compacta e a uma atividade transcricional reduzida. Estes activadores, incluindo a Tricostatina A, o Butirato de Sódio, o Vorinostat, o Panobinostat, o Ácido Valpróico, a Romidepsina, o Belinostat, o Entinostat, a Tacedinalina, o Givinostat, o Mocetinostat e a Chidamida, partilham um mecanismo de ação comum, na medida em que impedem a desacetilação do cluster 1 da histona H2B. Esta prevenção leva a uma acumulação de marcas de acetilação nas histonas. O aumento da acetilação da histona H2B do cluster 1 altera a interação entre as histonas e o ADN, enfraquecendo a ligação e resultando numa forma menos condensada de cromatina. Esta estrutura de cromatina mais relaxada permite que a maquinaria de transcrição aceda mais facilmente ao ADN, permitindo assim a ativação de processos de transcrição em que o cluster de histonas 1 H2B está envolvido.
Cada ativador químico, embora partilhe este mecanismo fundamental, pode apresentar particularidades na sua interação com os HDACs. A Tricostatina A e o Vorinostat, por exemplo, são inibidores de HDAC de largo espetro, afectando uma vasta gama de enzimas HDAC. Outros, como o entinostato, apresentam seletividade em relação aos HDAC de classe I. Esta seletividade pode influenciar a extensão e os locais específicos da acetilação da histona H2B do cluster 1. As marcas de acetilação fornecidas pela ação destes inibidores servem como sinais que recrutam outras proteínas envolvidas na regulação da transcrição, facilitando ainda mais a ativação da transcrição. Os padrões precisos de acetilação introduzidos por estes activadores podem, consequentemente, determinar os genes específicos que são expressos. Coletivamente, estes activadores químicos facilitam a transição do cluster 1 da histona H2B para um estado ativo conducente à expressão genética, promovendo um ambiente de cromatina que é acessível à maquinaria transcricional.
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