Os inibidores químicos da DUPD1 funcionam através de vários mecanismos para modular a atividade da proteína, interferindo com diferentes vias de sinalização e enzimas que são responsáveis pela sua regulação. Sabe-se que a bisindolilmaleimida I, por exemplo, inibe seletivamente a proteína quinase C (PKC), o que pode diminuir a atividade da DUPD1 se a PKC estiver envolvida na sua regulação. Do mesmo modo, a estaurosporina, um inibidor não seletivo da proteína cinase, pode inibir amplamente as cinases que podem fosforilar e ativar a DUPD1. Outros inibidores da quinase, como o LY294002 e a wortmannina, têm como alvo específico as fosfoinositídeo 3-quinases (PI3K), que, se fizerem parte da via reguladora da DUPD1, levarão a uma redução da ativação da proteína. Além disso, o PD98059 e o U0126, que inibem a proteína quinase quinase activada pelo mitogénio (MEK), e o SB203580, um inibidor da p38 MAP quinase, podem diminuir a atividade da DUPD1 ao impedir os sinais de fosforilação destas vias relacionadas com a MAPK.
De forma semelhante, o SP600125, que inibe a c-Jun N-terminal quinase (JNK), e o PP2, um inibidor das tirosina quinases da família Src, podem reduzir a atividade da DUPD1 bloqueando as respectivas quinases que podem ser necessárias para a sua ativação. A via mTOR, outra via reguladora de numerosas proteínas, pode ser inibida pela rapamicina, levando possivelmente a uma diminuição da atividade da DUPD1. O NF449, ao inibir seletivamente a subunidade Gs alfa das proteínas G, pode alterar a sinalização subsequentes que podem afetar a DUPD1. Por último, o Y-27632, que inibe a proteína quinase associada à Rho (ROCK), pode levar a uma redução da atividade da DUPD1 se a ROCK estiver envolvida na regulação das funções da DUPD1. Entre esses inibidores, cada um tem como alvo cinases ou vias específicas que, após inibição, podem alterar o estado funcional da DUPD1.
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