UBAC2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-407388

Übersicht

UBAC2 (ubiquitin-associated domain containing 2) kodiert ein ER-assoziiertes Protein, das an der ubiquitinabhängigen Proteinkontrolle und der Proteostase beteiligt ist. Aufgrund seiner Ubiquitin-Bindungseigenschaften und seiner subzellulären Lokalisation wurde UBAC2 mit der Regulation von ER-Stressantworten und dem Abbau fehlgefalteter Proteine in Verbindung gebracht und überschneidet sich dabei mit Signalwegen wie dem ER-assoziierten Abbau (ERAD) sowie der breiteren Ubiquitin-Proteasom-Signalisierung. Genetische Studien haben UBAC2-Loci mit immunbezogenen Phänotypen verknüpft, darunter Suszeptibilitätssignale, die bei entzündlichen und autoimmunen Erkrankungen berichtet wurden, was seine Relevanz für die Immunbiologie stützt. Diese Zusammenhänge machen UBAC2 zu einem nützlichen Ziel, um zu untersuchen, wie Ubiquitin-Signalisierung Stressanpassung und immunassoziierte zelluläre Zustände moduliert.

Das UBAC2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des UBAC2-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des UBAC2-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von UBAC2 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die UBAC2-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von UBAC2-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der UBAC2-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf UBAC2-Exone abzielen, die für die UBAC2-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere UBAC2-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom UBAC2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom UBAC2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des UBAC2-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das UBAC2 HDR-Plasmid (h) und UBAC2 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von UBAC2-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten UBAC2-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.