SNX9 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (m): sc-426112

Panoramica

Snx9 codifica la sorting nexin 9 (SNX9), una proteina adattatrice con domini SH3 e PX che collega il legame ai fosfoinositidi al rimodellamento della membrana e all’endocitosi mediata da clatrina. SNX9 coordina l’assemblaggio dei macchinari endocitici e di regolazione dell’actina interagendo con la dinamina e N-WASP, supportando la scissione delle vescicole, l’internalizzazione dei recettori e il traffico di membrana a livello della membrana plasmatica. Attraverso questi ruoli, SNX9 influenza la dinamica della segnalazione a valle dei recettori internalizzati e contribuisce alla riorganizzazione del citoscheletro durante processi quali la migrazione cellulare e il turnover di membrana. La disregolazione del traffico endocitico e del controllo dell’actina è implicata nella segnalazione associata al cancro e in fenotipi neurobiologici, rendendo Snx9 un nodo utile per studi meccanicistici sul riorientamento delle vie di segnalazione in contesti rilevanti per la malattia.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO SNX9 (m) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene Snx9 in linee cellulari mouse. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del Snx9 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto Snx9 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina SNX9.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di Snx9 per lo studio della segnalazione di SNX9, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni Snx9 critici per la funzione di SNX9
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di Snx9 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal SNX9 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m) e dal SNX9 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus Snx9. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal SNX9 Plasmide HDR (m) e il plasmide HDR SNX9 (m2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia Snx9 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio Snx9 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.