Ribosomal Protein S13 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-406367

Panoramica

RPS13 codifica la proteina ribosomiale S13, un componente essenziale della piccola subunità ribosomiale 40S che supporta l’assemblaggio del ribosoma, il processamento dell’rRNA e la corretta decodifica dell’mRNA durante la traduzione. Attraverso il suo ruolo nella sintesi proteica citosolica, RPS13 contribuisce al controllo della crescita cellulare e alla proteostasi e si interfaccia con vie sensibili alla capacità di traduzione, incluse risposte adattative allo stress e meccanismi di sorveglianza nucleolare. L’alterazione dell’omeostasi delle proteine ribosomiali è collegata alle ribosomopatie ed è stata associata a programmi di proliferazione modificati osservati in molteplici contesti oncologici, rendendo RPS13 un nodo utile per studiare come l’output traslazionale plasmi lo stato cellulare. In quanto fattore ribosomiale conservato, RPS13 è inoltre rilevante per investigare le dinamiche globali della traduzione, la traduzione selettiva di specifici mRNA e le conseguenze degli squilibri nella biogenesi dei ribosomi.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO Ribosomal Protein S13 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene RPS13 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del RPS13 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto RPS13 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina Ribosomal Protein S13.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di RPS13 per lo studio della segnalazione di Ribosomal Protein S13, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni RPS13 critici per la funzione di Ribosomal Protein S13
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di RPS13 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal Ribosomal Protein S13 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal Ribosomal Protein S13 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus RPS13. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal Ribosomal Protein S13 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR Ribosomal Protein S13 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia RPS13 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio RPS13 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.