HoxB5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-409631

概要

HOXB5は、ホメオボックス型転写因子HoxB5をコードしており、配列特異的にDNAへ結合して転写を制御することで、胚発生における前後軸パターニングや組織アイデンティティの確立に寄与します。HoxB5は、レチノイン酸応答性経路を含む発生モルフォゲンシグナルの下流にある転写プログラムに関与し、系譜（ラインエージ）決定、増殖、分化を協調的に制御します。成人の文脈では、HOXB5発現の破綻が細胞状態制御の変化や異常な転写ネットワークと関連し、複数のがんおよび造血系疾患のデータセットで観察されています。核内制御因子として、HoxB5はヒト細胞モデルにおける遺伝子制御回路、エンハンサー–プロモーターの制御ロジック、発生リプログラミング機構を解明する目的で一般的に研究されています。

HoxB5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるHOXB5遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、HOXB5内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、HOXB5のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、HoxB5タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、HoxB5シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、HOXB5欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• HoxB5の機能に不可欠なHOXB5エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、HOXB5ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• HoxB5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびHoxB5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、HOXB5遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  HoxB5 HDRプラスミド（h）および HoxB5 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはHOXB5ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のHOXB5標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。