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ZFR Plasmide di attivazione CRISPR (h) | sc-407242-ACT | 20 µg | $397.00 |
La ZFR umana (zinc finger RNA-binding protein) è un fattore di legame all’RNA prevalentemente nucleare, implicato nella regolazione genica post-trascrizionale, inclusa la modulazione dello splicing del pre‑mRNA e della processazione dell’RNA attraverso interazioni con complessi spliceosomiali e ribonucleoproteici. Modellando l’uso delle isoforme trascrittomiche e il destino dell’RNA, ZFR può influenzare programmi dello stato cellulare quali proliferazione, differenziamento ed espressione genica in risposta allo stress. Una processazione dell’RNA deregolata è una caratteristica comune del cancro e dei disturbi del neurosviluppo e neurodegenerativi, rendendo ZFR un bersaglio rilevante per studi meccanicistici delle reti di regolazione dell’RNA. Indagare la funzione di ZFR può aiutare a chiarire come le vie legate allo splicing e le proteine leganti l’RNA coordinino gli output di espressione genica nelle cellule umane.
ZFR Il plasmide di attivazione CRISPR (h) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di ZFR senza alterare la sequenza di DNA sottostante.
ZFR Il plasmide di attivazione CRISPR (h) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus ZFR nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.
Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione ZFR, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di ZFR. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus ZFR nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da ZFR nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via ZFR nelle cellule tumorali con espressione di ZFR silenziata o ridotta.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.