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PRDM11 Plasmide di attivazione CRISPR (h) | sc-417861-ACT | 20 µg | $397.00 |
PRDM11 codifica una proteina a dita di zinco contenente un dominio PR/SET, implicata nella regolazione della trascrizione associata alla cromatina e in programmi di espressione genica specifici di linea. In quanto membro della famiglia PRDM, PRDM11 è collegato a meccanismi di controllo epigenetico che coordinano le transizioni dello stato cellulare, inclusi differenziamento e mantenimento dell’identità cellulare. La deregolazione dei regolatori trascrizionali della famiglia PRDM è stata associata ad alterazioni delle vie di sviluppo e a reti di espressione genica aberranti nel cancro e in altri disturbi, motivando l’indagine dei circuiti trascrizionali dipendenti da PRDM11. Lo studio della funzione di PRDM11 supporta analisi meccanicistiche sul rimodellamento della cromatina, sul reclutamento di fattori di trascrizione e sul controllo dipendente dal contesto dei geni bersaglio a valle.
PRDM11 Il plasmide di attivazione CRISPR (h) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di PRDM11 senza alterare la sequenza di DNA sottostante.
PRDM11 Il plasmide di attivazione CRISPR (h) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus PRDM11 nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.
Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione PRDM11, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di PRDM11. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus PRDM11 nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da PRDM11 nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via PRDM11 nelle cellule tumorali con espressione di PRDM11 silenziata o ridotta.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.