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POLR1E CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-407602-ACT | 20 µg | $397.00 |
POLR1EはRNAポリメラーゼIの中核サブユニットをコードしており、RNAポリメラーゼIは核小体においてリボソーム生合成の開始となるリボソームRNA前駆体(pre-rRNA)を転写する多タンパク質複合体です。POLR1Eはpre-rRNAの合成とプロセシングを支えることで、細胞増殖の制御、プロテオスタシス(タンパク質恒常性)維持能力、ならびにリボソーム産生を細胞周期制御へと結び付ける核小体ストレスシグナル伝達経路に寄与します。RNAポリメラーゼI機能の攪乱はタンパク質合成の恒常性を乱し、p53関連チェックポイントなどのストレス応答を活性化し得るため、POLR1Eは増殖・分化・ゲノム安定性の研究において重要な対象となります。遺伝学的証拠から、POLR1Eの機能不全はヒトのリボソーム病(ribosomopathy)の表現型や発達障害と関連することが示されており、生合成需要の高い組織における重要性が示唆されます。
POLR1E CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性POLR1Eの発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
POLR1E CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における POLR1E 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はPOLR1E転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性POLR1Eの発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のPOLR1E遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるPOLR1E依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびPOLR1E発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるPOLR1E経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。