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CDK11 Plasmide di attivazione CRISPR (h) | sc-405330-ACT | 20 µg | $397.00 |
Il CDK19 umano codifica una chinasi ciclina-dipendente che funge da componente regolatorio del modulo CDK associato al complesso Mediator, coordinando la trascrizione responsiva agli stimoli con il controllo del ciclo cellulare. Influenzando i programmi trascrizionali della RNA polimerasi II, CDK19 contribuisce alla regolazione della proliferazione, della segnalazione dello stress e della differenziazione attraverso vie collegate a MAPK e ad altre reti sensibili ai fattori di crescita. Un’attività deregolata di CDK19 e la segnalazione Mediator-kinase sono state associate a un riassetto trascrizionale nella biologia del cancro e a risposte cellulari alterate a stimoli genotossici e infiammatori. Queste caratteristiche rendono gli studi sull’asse CDK19/CDK11 rilevanti per analizzare il controllo dell’espressione genica dipendente dal contesto nelle cellule umane.
CDK11 Il plasmide di attivazione CRISPR (h) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di CDK19 senza alterare la sequenza di DNA sottostante.
CDK11 Il plasmide di attivazione CRISPR (h) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus CDK19 nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.
Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione CDK19, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di CDK11. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus CDK19 nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da CDK11 nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via CDK11 nelle cellule tumorali con espressione di CDK19 silenziata o ridotta.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.