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cathepsin B Plasmide di attivazione CRISPR (m) | sc-419873-ACT | 20 µg | $397.00 |
Il gene murino Ctsb codifica la catepsina B, una proteasi cisteinica lisosomiale che partecipa al turnover intracellulare delle proteine e alla processazione dei peptidi all’interno del sistema endo-lisosomiale. La catepsina B contribuisce al flusso autofagia-lisosoma, al rimodellamento della matrice extracellulare dopo la secrezione e a eventi di segnalazione proteolitica che intersecano vie infiammatorie e la processazione dell’antigene. Un’attività di CTSB deregolata è stata collegata a difetti di proteostasi associati alla neurodegenerazione, alla biologia dell’invasione tumorale e all’infiammazione metabolica, rendendola un target ampiamente utilizzato per studiare le risposte allo stress lisosomiale. Nei modelli murini, l’espressione di Ctsb viene spesso valutata in contesti di attivazione microgliale, fibrosi e rimodellamento tissutale, in cui l’equilibrio delle proteasi lisosomiali determina il fenotipo cellulare.
cathepsin B Il plasmide di attivazione CRISPR (m) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di Ctsb senza alterare la sequenza di DNA sottostante.
cathepsin B Il plasmide di attivazione CRISPR (m) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus Ctsb nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.
Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione Ctsb, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di cathepsin B. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus Ctsb nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da cathepsin B nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via cathepsin B nelle cellule tumorali con espressione di Ctsb silenziata o ridotta.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.