atonal アクチベーター

一般的な無色活性剤には、5-Aza-2′-Deoxycytidine CAS 2353-33-5、レチノイン酸、オールトランス CAS 302-79-4 、SB 431542 CAS 301836-41-9、リチウム CAS 7439-93-2、トリコスタチン A CAS 58880-19-6などがある。

生化学的な文脈におけるアトナール・アクチベーターとは、塩基性ヘリックス-ループ-ヘリックス（bHLH）転写因子のアトナールファミリーに関連するタンパク質の活性調節に関与する一群の化学化合物を指す。これらの転写因子は、神経系の発達に不可欠なショウジョウバエの遺伝子アトナールにちなんで命名された。様々な生物のアトナールタンパク質は、これらの分化過程に関与する遺伝子の発現を制御することによって、感覚器官やニューロンの発生に重要な役割を果たしている。したがって、アトナール関連タンパク質の活性化因子とは、これらの因子の転写活性を増強する分子であり、DNAへの結合を促進したり、転写因子複合体を安定化したり、共活性化因子のリクルートを促進したり、あるいは抑制因子の作用を阻害したりすることによって、これらの因子の転写活性を増強する可能性がある。アトナル活性化因子の化学組成は多様であり、低分子、ペプチド、あるいは細胞核に侵入して転写機構と相互作用できる他の形態の生物学的に活性な物質が含まれる可能性がある。

このような無調性活性物質をさらに詳しく研究するためには、無調性タンパク質がDNAや転写装置の他の構成要素と相互作用する詳細なメカニズムを理解するための広範な研究が必要であろう。これらの転写因子の3次元構造、特にDNA結合ドメインと転写活性化に重要なタンパク質間相互作用を担う領域を解読するには、X線結晶構造解析やクライオ電子顕微鏡などの技術を用いた構造研究が必要であろう。この構造的洞察があれば、科学者たちは、アトナルタンパク質と相互作用し、活性化する可能性のある化合物のライブラリーをスクリーニングするために、計算機的アプローチを用いることができる。その後の合成作業によって、これらの候補分子が生成され、一連の生化学的・生物物理学的アッセイにかけられることになる。これらのアッセイは、化合物がアトナールタンパク質のDNA結合親和性を高め、二量体化や他の転写共活性化因子との複合体形成を促進し、最終的に標的遺伝子の転写活性を高める能力を定量化するように設計される。設計、合成、機能試験の反復サイクルにより、アトナール活性化剤の化学的クラスが構築され、アトナールファミリーのタンパク質との特異的な相互作用によって特徴づけられる。