ZNF101 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-413991

Panoramica

ZNF101 codifica una proteina a dita di zinco di tipo C2H2 che si prevede funzioni come regolatore della trascrizione legandosi al DNA in modo sequenza-specifico. Nell’ambito delle reti di fattori di trascrizione a dita di zinco, ZNF101 dovrebbe contribuire al controllo dell’espressione genica associato alla cromatina, influenzando programmi che determinano l’identità cellulare, la proliferazione e le risposte allo stress. L’alterazione della regolazione trascrizionale mediata da dita di zinco è spesso collegata a stati epigenetici disregolati e a fenotipi oncogenici o dello sviluppo, rendendo ZNF101 rilevante per studi meccanicistici dei circuiti di regolazione genica. ZNF101 umano è quindi di interesse per mappare le vie di controllo trascrizionale e identificare ruoli dipendenti dal contesto nell’omeostasi cellulare e nelle firme di espressione genica associate a malattia.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO ZNF101 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene ZNF101 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del ZNF101 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto ZNF101 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina ZNF101.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di ZNF101 per lo studio della segnalazione di ZNF101, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni ZNF101 critici per la funzione di ZNF101
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di ZNF101 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal ZNF101 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal ZNF101 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus ZNF101. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal ZNF101 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR ZNF101 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia ZNF101 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio ZNF101 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.