ZFP101 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (m): sc-423758

Panoramica

Zfp101 del topo codifica ZFP101, una proteina a dita di zinco di tipo C2H2 prevista, implicata nel legame al DNA in modo sequenza-specifico e nella regolazione della trascrizione. In quanto potenziale fattore nucleare, ZFP101 può contribuire al controllo dell’espressione genica associato alla cromatina, coordinando programmi che regolano transizioni dello stato cellulare come proliferazione, differenziamento e trascrizione in risposta allo stress. L’alterazione delle reti regolatorie mediate da dita di zinco è ampiamente rilevante per i meccanismi alla base di fenotipi dello sviluppo e della trascrizione deregolata osservata nelle malattie complesse, inclusi il cancro e i disturbi del neurosviluppo. Zfp101 rappresenta quindi un locus utile per indagare come repressori/attivatori trascrizionali plasmino la segnalazione a valle e i profili di espressione genome-wide in sistemi modello murini.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO ZFP101 (m) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene Zfp101 in linee cellulari mouse. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del Zfp101 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto Zfp101 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina ZFP101.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di Zfp101 per lo studio della segnalazione di ZFP101, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni Zfp101 critici per la funzione di ZFP101
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di Zfp101 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal ZFP101 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m) e dal ZFP101 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus Zfp101. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal ZFP101 Plasmide HDR (m) e il plasmide HDR ZFP101 (m2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia Zfp101 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio Zfp101 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.