Gli oligonucleotidi YY1 Gel Shift sono brevi sequenze di DNA meticolosamente realizzate per l'uso in saggi di gel shift, una tecnica fondamentale in biologia molecolare utilizzata per esaminare le interazioni proteina-DNA. Questi oligonucleotidi, che prendono il nome dal fattore di trascrizione Yin Yang 1 (YY1), derivano dalla sequenza di legame consensuale riconosciuta da YY1, un fattore di trascrizione multifunzionale con diversi ruoli nella regolazione genica, nella proliferazione cellulare, nel differenziamento e nell'apoptosi. YY1 esercita la sua influenza regolatoria legandosi a specifiche sequenze di DNA, denominate motivi YY1, all'interno dei promotori e degli esaltatori dei geni bersaglio, modulando così la loro attività trascrizionale. Utilizzando gli oligonucleotidi YY1 Gel Shift nei saggi Gel Shift, i ricercatori possono approfondire la cinetica di legame, la specificità e l'affinità di YY1 ai motivi YY1 in diverse condizioni sperimentali. Questa tecnica facilita l'elucidazione dei meccanismi molecolari alla base della regolazione genica mediata da YY1 e fornisce approfondimenti sulle complesse reti di segnalazione che regolano processi cellulari come lo sviluppo, il differenziamento e l'oncogenesi.
Riferimenti:
- YY1 lega cinque elementi cis e transattiva il promotore di gp91(phox), limitato alle cellule mieloidi. | Jacobsen, BM. and Skalnik, DG. 1999. J Biol Chem. 274: 29984-93. PMID: 10514482
- Il fattore nucleare delle cellule T attivate e YY1 si combinano per reprimere l'espressione di IL-5 in una linea di cellule T umane. | Schwenger, GT., et al. 1999. J Allergy Clin Immunol. 104: 820-7. PMID: 10518827
- Il regolatore trascrizionale Yin Yang 1 attiva il gene PLP della mielina. | Berndt, JA., et al. 2001. J Neurochem. 77: 935-42. PMID: 11331422
- YY1 reprime la trascrizione della 25-idrossivitamina D(3)24-idrossilasi mediata dal recettore della vitamina D: alleggerimento della repressione da parte della CREB-binding protein. | Raval-Pandya, M., et al. 2001. Mol Endocrinol. 15: 1035-46. PMID: 11376120
- YY1 è un regolatore positivo della trascrizione del gene Col1a1. | Riquet, FB., et al. 2001. J Biol Chem. 276: 38665-72. PMID: 11514536
- Il fattore di trascrizione YY1 regola in modo negativo l'espressione di CCR5, uno dei principali corecettori dell'HIV-1. | Moriuchi, M. and Moriuchi, H. 2003. J Biol Chem. 278: 13003-7. PMID: 12571248
- Yin-yang 1 regola negativamente la trascrizione differenziata del gene loricrin di topo nei cheratinociti indifferenziati. | Xu, X., et al. 2004. J Invest Dermatol. 123: 1120-6. PMID: 15610523
- Induzione da parte di Exendin-4 dell'espressione di Egr-1 nelle beta-cellule INS-1: interazione di SRF, non di YY1, con il sito SRE del promotore di Egr-1 di ratto. | Kim, MJ., et al. 2008. J Cell Biochem. 104: 2261-71. PMID: 18446785
- Una variante comune del promotore di TBX21 è associata al legame allele-specifico con Yin-Yang 1 e a una ridotta espressione del gene. | Li, JR., et al. 2011. Scand J Immunol. 73: 449-58. PMID: 21272048
- YY1 regola negativamente l'espressione genica della proteolipide mielinica di topo (Plp1) nelle cellule oligodendrogliali. | Zolova, OE. and Wight, PA. 2011. ASN Neuro. 3: PMID: 21973168
- La proteina della matrice nucleare NMP-1 è il fattore di trascrizione YY1. | Guo, B., et al. 1995. Proc Natl Acad Sci U S A. 92: 10526-30. PMID: 7479833
- YY1 reprime l'espressione del gene della beta-caseina impedendo la formazione di un complesso associato alla lattazione. | Raught, B., et al. 1994. Mol Cell Biol. 14: 1752-63. PMID: 8114709
- Identificazione e caratterizzazione del promotore del gene XIST umano: implicazioni per i modelli di inattivazione del cromosoma X. | Hendrich, BD., et al. 1997. Nucleic Acids Res. 25: 2661-71. PMID: 9185579
- Regolazione della trascrizione RNA polimerasi II-dipendente attraverso la poli(ADP-ribosilazione) dei fattori di trascrizione. | Oei, SL., et al. 1998. J Biol Chem. 273: 31644-7. PMID: 9822623
- Identificazione di due elementi repressori nel promotore del collagene alfa 2(I) di topo. | Miao, K., et al. 1999. Arch Biochem Biophys. 361: 7-16. PMID: 9882423