Xylene Cyanol FF (CAS 2650-17-1)

Lo Xylene Cyanol FF, con numero CAS 2650-17-1, è un colorante sintetico comunemente utilizzato nella ricerca in biologia molecolare e biochimica, in particolare nella visualizzazione di biomolecole durante le tecniche elettroforetiche. Questa sostanza chimica appartiene alla famiglia dei coloranti triarilmetanici ed è riconosciuta per il suo distinto colore blu-verde. Lo Xylene Cyanol FF funziona principalmente come colorante di tracciamento nelle applicazioni di elettroforesi su gel, contribuendo alla stima della migrazione degli acidi nucleici attraverso gel di agarosio o poliacrilammide. In condizioni elettroforetiche tipiche, il colorante si carica negativamente e migra nella stessa direzione dei frammenti di DNA o RNA verso l'anodo. Nell'uso pratico, lo Xylene Cyanol FF migra in genere alla stessa velocità di circa 4.000 coppie di basi di frammenti di DNA in un gel di agarosio standard e di circa 106 coppie di basi in gel di poliacrilammide, fornendo così ai ricercatori un riferimento visivo per valutare il progresso e le dimensioni approssimative dei frammenti di acido nucleico durante la separazione. Oltre al suo ruolo nella visualizzazione, la sua struttura molecolare viene utilizzata nella ricerca per comprendere le interazioni colorante-biomolecola, contribuendo allo sviluppo di protocolli di colorazione e tecniche analitiche migliori nelle scienze della vita. La sua applicazione si estende anche ad altre aree di ricerca, tra cui l'uso come indicatore di pH e come componente nella formulazione di vari standard di colore.