SYND3/SDC3/Syndecan-3 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (m): sc-423236

Descripción general

Sdc3 codifica el sindecán-3 (SYND3/SDC3), un proteoglucano transmembrana de heparán sulfato que organiza en la superficie celular señales de la matriz extracelular y gradientes de factores de crecimiento. Al unirse a ligandos dependientes de heparán sulfato, SDC3 modula la señalización de receptores tirosina quinasa y de quimiocinas, influyendo en la remodelación del citoesqueleto, la migración celular, el crecimiento de neuritas y la plasticidad sináptica. En el ratón, Sdc3 es prominente en tejidos neuronales y metabólicos y contribuye a vías que regulan la guía axonal, la adhesión célula–matriz y la señalización inflamatoria. La desregulación de la función del sindecán-3 se ha asociado con procesos de neurodesarrollo y neuroinflamación, así como con fenotipos de balance energético alterado, lo que respalda su uso como un nodo mecanístico en la investigación del SNC y del metabolismo.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO SYND3/SDC3/Syndecan-3 (m) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen Sdc3 en líneas celulares mouse. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del Sdc3 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de Sdc3 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína SYND3/SDC3/Syndecan-3.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en Sdc3 para la investigación de la señalización de SYND3/SDC3/Syndecan-3, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de Sdc3 críticos para la función de SYND3/SDC3/Syndecan-3
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de Sdc3 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido SYND3/SDC3/Syndecan-3 CRISPR/Cas9 KO (m) y el plásmido SYND3/SDC3/Syndecan-3 CRISPR/Cas9 KO (m2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus Sdc3. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR SYND3/SDC3/Syndecan-3 (m) y el plásmido HDR SYND3/SDC3/Syndecan-3 (m2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología Sdc3 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana Sdc3 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.