Sulfo-SDA (Sulfo-NHS-Diazirine)

Il Sulfo-SDA, noto anche come Sulfo-NHS-Diazirina, è un reagente chimico specializzato ampiamente utilizzato nel campo della biochimica per l'etichettatura di fotoaffinità, in particolare nello studio delle interazioni proteina-proteina e proteina-ligando. Questo composto è composto da un gruppo sulfo-NHS (N-idrossisolfosuccinimmide) e da un gruppo diazirina, ciascuno dei quali fornisce funzionalità distinte che ne aumentano l'utilità nella ricerca sperimentale. L'estere sulfo-NHS del Sulfo-SDA ne facilita la coniugazione con i gruppi amminici primari delle proteine, in genere i gruppi amminici dei residui di lisina o i terminali N di peptidi e proteine. Questa reazione forma legami ammidici stabili, marcando efficacemente la proteina con il gruppo diazirinico fotoattivabile. Il gruppo sulfo aumenta la solubilità del composto in acqua, rendendolo molto adatto all'uso in varie condizioni fisiologiche senza bisogno di solventi organici. La diazirina, come gruppo funzionale fondamentale nel Sulfo-SDA, funge da reticolante fotoattivabile. All'esposizione alla luce ultravioletta, il gruppo diazirinico genera un intermedio carbenico altamente reattivo. Questo intermedio può formare rapidamente e in modo non selettivo legami covalenti con strutture molecolari vicine, comprese proteine e altre biomolecole. Questa proprietà è fondamentale per catturare le interazioni molecolari fugaci all'interno dei loro contesti biologici nativi, fornendo preziose informazioni sui processi dinamici che avvengono all'interno delle cellule viventi. Il Sulfo-SDA è stato ampiamente utilizzato in biologia molecolare e proteomica per mappare le reti di interazione, studiare la topologia dei complessi proteici e spiegare i meccanismi degli assemblaggi biomolecolari. La capacità di collegare in modo permanente molecole interagenti in situ lo rende uno strumento indispensabile nell'arsenale dei metodi di studio dei sistemi biologici complessi.