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SRm300 Plasmide di attivazione CRISPR (h) | sc-403447-ACT | 20 µg | $397.00 |
SRRM2 codifica SRm300, una grande proteina nucleare ricca di serina/arginina che funge da impalcatura all’interno dello spliceosoma e regola le scelte di splicing del pre-mRNA. SRm300 si associa alle proteine SR e ad altri fattori di splicing negli speckle nucleari per coordinare la definizione degli esoni, lo splicing alternativo e l’accoppiamento tra trascrizione e processamento dell’RNA. Attraverso queste attività, SRRM2 contribuisce alla diversità delle isoforme trascrittiche e alla regolazione del proteoma in vie che governano la progressione del ciclo cellulare, le risposte al danno al DNA e la differenziazione cellulare. Programmi di splicing deregolati e dinamiche spliceosomiali alterate associate a SRRM2 sono stati collegati a fenotipi rilevanti per la malattia in contesti di ricerca sul cancro e sulle patologie neurodegenerative, in cui un uso aberrante delle isoforme può influenzare gli output di segnalazione.
SRm300 Il plasmide di attivazione CRISPR (h) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di SRRM2 senza alterare la sequenza di DNA sottostante.
SRm300 Il plasmide di attivazione CRISPR (h) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus SRRM2 nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.
Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione SRRM2, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di SRm300. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus SRRM2 nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da SRm300 nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via SRm300 nelle cellule tumorali con espressione di SRRM2 silenziata o ridotta.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.